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査読有論文 (*責任著者)

1. 景政柊蘭, 長町晃宏, 井口晃徳, 久保田健吾, 高橋優信, 原田秀樹, 押木守, 荒木信夫, 大久保努, 上村繁樹, 多川正*. 2018. 最初沈殿池+DHSシステムに付加する下水処理水の灌漑利用のための消毒システムの開発. 土木学会論文集G(環境). 74(7): III_333-III_340.
2. 大久保勉*, 上村繁樹, 井口晃徳, 多川正, 押木守, 久保田健吾, 荒木信夫, 原田秀樹, Ahmed Tawfik, 市村禎二郎. 2018. エジプトの高校生を対象とした「水」に関する環境教育プログラムの開発と実践. 下水道協会誌. 55(665): 76-82.
3. 野本直樹*, Vinay Kumar Tyagi, Muntjeer Ali, Komal Jayaswal, Namita Maharjan, 井口晃徳, 幡本将史, 大久保努, 高橋優信, 久保田健吾, 多川正, 上村繁樹, 山口隆司, 原田秀樹. 2017. 開発途上国における実機スケールDHSリアクターのスタートアップ特性および高有機物負荷条件下における有機物処理性能. 水環境学会誌. 40(1):11-19.
4. 類家渉, 山本歩, 矢口淳一, 久保田健吾, 李玉友. 2016. PMA-qPCR法へのLED光源の適用とろ過濃縮の影響. 土木学会論文集G(環境). 72(7): III_315-III_323.
5. 長町晃宏, 井口晃徳, 瀬戸雄太, 久保田健吾, 押木守, 荒木信夫, 大久保努, 上村繁樹, 高橋優信, 原田秀樹, 多川正. 2016. 一次沈澱+DHSシステムによる衛生指標微生物の処理性能評価. 土木学会論文集G(環境). 72(7): III_187-III_195.
6. 馬海元, 張彦隆, 何士龍, 牛啓桂, 久保田健吾, 李玉友. 2015. UASB型ANAMMOXプロセスの処理性能に及ぼす基質濃度変化の影響. 土木学会論文集G(環境). 71(7): III_397-III_404.
7. 大久保努, 高橋優信, 久保田健吾, 原田秀樹, 時田政輝, 上村繁樹, 前野一夫. 2015. 途上国のための新規下水処理装置”DHS”におけるスポンジ担体の水の流れと酸素の取込特性の評価. 実験力学. 15(1): 30-37.
8. 大久保努*, 井口晃德, 久保田健吾, 山口隆司, 上村繁樹, 原田秀樹. 実証規模DHSリアクターの処理性能と硝化細菌群に及ぼすスポンジ担体の影響. 下水道協会誌. 51(623): 121-128.
9. 谷川大輔*, 久保田健吾, 佐瀬信哉, 珠坪一晃, Chen Sau Soon, Yunus Mohammed Faisal Mohammed, 山口隆司, 原田秀樹. 2013. パームオイル工場廃液を処理するラグーンシステムからのメタンガス放出量の測定. 土木学会論文集G (環境). 69(4): 157-165.
10. 渋谷幸子, 石川愛弓, 玉木秀幸, 原田秀樹, 久保田健吾*. 高塩濃度環境下においてニッケルが微生物群集構造に与える影響の評価とニッケル耐性細菌の分離・培養. 2013. 土木学会論文集G (環境). 69(7): III_241-III_248.
11. 井口晃德*, 大久保努, 立花真, 永井寛之, 上村繁樹, 山口隆司, 久保田健吾, 原田秀樹. 2013. 実証規模DHSリアクターの微生物群集構造解析と脱窒細菌群の定量. 土木学会論文集G (環境). 69(7): III_539-III_546.
12. 坂本健一, 幡本将史, 高橋優信, 久保田健吾, 荒木信夫, 山崎慎一, 大久保努, 上村繁樹, 原田秀樹, 山口隆司*. 2013. 嫌気無酸素回分式リアクターを用いた都市下水からの栄養塩除去とリン回収. 土木学会論文集G (環境). 69(7): III_121-III_127.
13. 松永健吾, 久保田健吾*, Erica Vonasek, 竹村泰幸, 原田秀樹. 2012. 18S rRNA遺伝子情報を用いた排水処理汚泥の真核生物群集構造解析. 土木学会論文集G (環境). 68(7): III_13-III_20.
14. 石川愛弓, 渋谷幸子, 玉木秀幸, 原田秀樹, 久保田健吾*. 2012. 分子生物学的手法及び培養法による埋立地浸出水処理微生物群集の構造解析. 土木学会論文集G (環境). 68(7): III_21-III_30.
15. 射手園章吾, 久保田健吾*, 谷川大輔, 珠坪一晃, 関口勇地, 山口隆司, 原田秀樹. 2011. 微生物コミュニティレベルでみる高級脂肪酸阻害メカニズム. 土木学会論文集G (環境). 67(7): III_51-III_58.
16. 渋谷幸子, 久保田健吾*, 谷川大輔, 射手園章吾, 珠坪一晃, 山口隆司, 関口勇地, S. S. Chen, M. F. M. Yunus, 原田秀樹. 2011. パームオイル圧搾廃液 (POME) を処理する密閉型嫌気性消化槽の処理特性と微生物群集構造. 土木学会論文集G (環境). 67(7): III_59-III_68.
17. 山田真義*, 久保田健吾, 高橋優信, 田中秀治, 山口隆司, 長野晃弘, 原田秀樹, 山内正仁. 2011. UASB-DHSシステムによる高濃度フェノール廃水の連続処理特性とUASB内微生物叢解析. 土木学会論文集G (環境). 67(7): III_75-III_84.
18. 竹村泰幸, 関口勇地, 原田秀樹, 久保田健吾*. 2011. 分子量分画膜を用いた迅速・簡便な配列特異的rRNA定量法の開発. 土木学会論文集G (環境). 67(7): III_85-III_92. [第48回環境工学研究フォーラム論文賞]
19. 山口剛士, 川上周司*, 幡本将史, 高橋優信, 久保田健吾, 井町寛之, 荒木信夫, 山口隆司. 2011. Hybridization Chain Reaction (HCR) 法を用いた新規高感度FISH法の開発. 土木学会論文集G (環境). 67(7): III_93-III_98.
20. 大久保努*, 山口隆司, 久保田健吾, 原田秀樹. 2010. 無曝気方式の新規下水処理技術の開発 -第三世代型担体を適用した実規模DHSリアクターの処理性能評価-. 土木学会論文集G. 66: 149-158.
21. 久保田健吾*, 林幹大, 松永健吾, 大橋晶良, 李玉友, 山口隆司, 原田秀樹. 2010. 都市下水処理UASB-DHSシステムにおけるG3型DHSリアクターの微生物群集構造解析. 土木学会論文集G. 66: 56-64.
22. 大久保努, 渡辺悠介, 大浦一恵, 久保田健吾, 李玉友, 原田秀樹*. 2010. DHS-USB方式による埋立地浸出水の省エネルギー型窒素除去システムの開発. 土木学会論文集G. 66: 9-16.
23. 長谷川拓也, 川上周司, 久保田健吾*, 井町寛之, 大橋晶良, 原田秀樹. 2009. 機能遺伝子を標的としたtwo-pass TSA-FISH法による環境中未培養微生物の機能推定. 環境工学研究論文集. 46: 537-544.
24. 松永健吾, 小野寺崇, 上村繁樹, 山田真義, 山内正仁, 高橋優信, 久保田健吾, 原田秀樹, 山口隆司*. 2009. 下水処理UASB後段のDHSにおける余剰汚泥量の抑制要因の評価. 環境工学研究論文集. 46: 623-628.
25. 小林拓朗, 李玉友*, 久保田健吾, 原田秀樹. 2009. バイオガスの生物脱硫に寄与する硫黄マットの反応環境と微生物生態. 環境技術. 38: 642-651.
26. 小林拓朗, 李玉友*, 久保田健吾, 原田秀樹, 前田武己, 河合和保, 吉田尊彦. 2009. 硫黄酸化細菌を利用したメタン発酵槽の微好気環境下におけるバイオガス脱硫. 土木学会論文集G. 65: 104-113.
27. 服部賢, 小地沢俊宏, 渡辺悠介, タンドカール・マダン, 久保田健吾, 李玉友, 原田秀樹*. 2008. DHSリアクターによる無曝気方式硝化プロセスの処理特性. 環境工学研究論文集. 45: 317-324.
28. 小林拓朗, 安田大介, 李玉友*, 久保田健吾, 原田秀樹, 岡庭良安. 2008. 余剰活性汚泥の嫌気性自己分解によるメタン発酵スタートアップ方法およびその過程における微生物群構造の変化. 水環境学会誌. 31: 525-532.
29. 堆洋平, 李玉友*, 久保田健吾, 原田秀樹. 2008. デンプンの高温水素発酵細菌群の構造解析. 生物工学会誌. 86: 157-163.
30. 川上周司, 久保田健吾, 井町寛之, 原田秀樹, 大橋晶良*. 2006. Two-pass TSA-FISH法によるメタン生成古細菌のmcr遺伝子の検出. 環境工学研究論文集. 43: 143-148.
31. 久保田健吾, 大橋晶良*, 井町寛之, 原田秀樹. 2003. メタン生成古細菌にCARD-FISH法を適用するための細胞壁処理. 環境工学研究論文集. 40: 363-371.

総説 (*責任著者)

1. 長谷川拓也, 川上周司, 井町寛之, 大橋晶良, 原田秀樹, 久保田健吾*. 2010. Two-pass TSA-FISH法を用いた微生物機能遺伝子の視覚的検出技術. 環境バイオテクノロジー学会誌. 10: 97-103.

解説

1. 久保田健吾. 2018. 嫌気性処理における微生物群集構造解析. 環境システム計測制御学会. 22(4): 36-40.
2. 久保田健吾. 2015. 総論 水処理分野における顕微鏡観察. 水環境学会誌. 38(10): 360-364.

本

1. 分担執筆, 顕微鏡の基礎, 進化する顕微鏡, 嫌気性廃水処理の微生物「環境と微生物の事典」
2. 山口隆司, 山口剛士, 幡本将史, 中村明靖, 川上周司, 久保田健吾. 2013.10. 微生物検出向け新規高感度FISH法の開発. pp. 75-88. [監修] 渡邉一哉. 微生物燃料電池による廃水処理システム最前線. NTS.
3. 山口隆司, 高橋優信, 幡本将史, 川上周司, 久保田健吾, 原田秀樹, 山田真義, 山内正仁, 荒木信夫, 山崎慎一. 2011. 6. 次世代水資源循環技術−都市下水を対象とした嫌気性下水処理−. pp. 121-131. [監修] 菅原正孝. 水浄化技術の最新動向. 第2章 下水・廃水処理技術. CMC出版.

特許

1. 特開2011-135799. 生体高分子の検出及び／又は同定方法. 久保田健吾*, 竹村泰幸, 関口勇地, 原田秀樹.

学会誌・一般誌など

1. 久保田健吾. Microbial autecologyを楽しんだISME-12. 日本微生物生態学会誌. 2009. 24: 16-17.
2. サステナ 2009年 第12号 フィールド便り「見て触れる挑戦者」pp. 104-106.
3. 久保田健吾. ドイツ・マックスプランク海洋微生物学研究所滞在記. 日本微生物生態学会誌. 2007. 22: 77-78.